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Des projets innovants pour la compréhension des impacts de la variation génétique sur la maladie et la résistance aux antimicrobiens

Découvrez deux projets de recherche pilotés par le professeur Christian Landry du Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique qui ont obtenu un financement des Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC).

Genetic dissection of an entire protein interactome at the resolution of individual amino acids 
Le premier projet du professeur Landry vise à comprendre comment les mutations du génome humain modifient l’activité des protéines et modifient leur organisation spatiale et temporelle, un facteur déterminant dans de nombreuses maladies humaines. L'équipe de recherche a développé des approches permettant de quantifier la réponse de ces mutations sur la force et la spécificité des interactions protéine-protéine. Elle se concentre sur les interactions entre des protéines qui agissent comme des clés et des sessures, jouant un rôle crucial dans des processus biologiques fondamentaux comme la réponse aux stresses. Les résultats fourniront une meilleure cartographie des effets des mutations affectant la liaison des protéines, facilitant ainsi l'interprétation des variations génétiques humaines. Le projet a reçu un financement de 1 380 000 $ sur cinq ans du programme de subventions Projet.

Fungal AMR saturation base editing (FASBE) for enabling machine learning-guided infection treatment and prognostic in clinical settings
Le deuxième projet du professeur Landry répond à un besoin urgent en médecine de précision pour les infections microbiennes, notamment les infections fongiques graves. Celles-ci affectent 2 % des Canadiens et sont souvent difficiles à traiter en raison de mutations liées à la résistance aux antimicrobiens. La médecine de précision pour les infections microbiennes nécessite de comprendre comment la constitution génétique des micro-organismes influence le succès et les résultats des traitements antimicrobiens. Parmi les techniques utilisées se retrouve la détection de la sensibilité et de la résistance aux médicaments à partir des séquences d'ADN des microbes. Toutefois, dû à un manque de données de référence solides, l'interprétation des séquences pour la résistance aux médicaments n’est loin d’être optimale.

Le projet vise à développer des technologies de biologie synthétique et d’édition génomique de précision pour générer des données robustes sur la résistance aux antifongiques, facilitant ainsi l'interprétation des séquences d'ADN pour le diagnostic et le traitement des infections. Ces travaux de recherche sont financés à la hauteur de 350 000 $ sur deux ans dans le cadre du programme Mise au Point et Validation de Nouvelles Techniques et Technologies Biomédicales des IRSC.